2013年10月に就任した落合博満ゼネラルマネジャー(GM)との契約が1月31日を持って満了。契約は更新されず、退団となった。

　落合GMは04年に監督に就任し、11年に勇退するまでリーグ優勝4度、日本一1度と黄金期をもたらした。荒木、井端(現巨人コーチ)の二遊間「アライバ」コンビに代表される強固な守備で守り勝つスタイルを築いた。13年にGMとしてフロント入りし、新たな黄金期到来を目指して手腕を振るったが、チームは4年連続Bクラスに低迷。昨季は19年ぶりの最下位に沈み、退陣することとなった。西山球団代表は「新しいドラゴンズの基礎をしっかり作ってくれた」と評価した。